Genomik, transkriptomik ve proteomik veri setleri üzerinde kapsamlı biyoinformatik analizler gerçekleştiriyoruz. Python ve R programlama dilleri ile istatistiksel modelleme, diferansiyel ekspresyon analizi ve veri görselleştirme hizmetleri sunuyoruz.
RNA-seq verilerinin kalite kontrolü, hizalama, sayım matrisi oluşturma, diferansiyel ekspresyon analizi ve fonksiyonel zenginleştirme analizleri.
Varyant anotasyonu, SNP/Indel filtreleme, GWAS sonuçlarının görselleştirilmesi ve halka açık genomik veritabanlarından veri çekme ve işleme.
Protein-protein etkileşim ağları, pathway zenginleştirme analizi, GO term anotasyonu ve fonksiyonel sınıflandırma çalışmaları.
Çoklu test düzeltmeleri, regresyon modelleri, kümeleme analizleri ve makine öğrenimi tabanlı sınıflandırma yöntemlerinin uygulanması.
Projeye özel Python ve R scriptleri, Snakemake veya Nextflow tabanlı tekrarlanabilir iş akışları ve otomatik raporlama sistemleri.
Ham verilerin kalite değerlendirmesi, düşük kaliteli örneklerin filtrelenmesi, batch efektlerinin düzeltilmesi ve normalizasyon işlemlerinin uygulanması.
Diferansiyel ekspresyon, korelasyon analizleri, PCA, t-SNE, UMAP boyut indirgeme ve hiyerarşik kümeleme yöntemlerinin uygulanması.
Isı haritaları, volkan grafikleri, MA plotları, yolak diyagramları ve interaktif görselleştirmeler ile kapsamlı analiz raporları.
Kullanılan tüm kod, parametre ve yöntemleri içeren detaylı dokümantasyon. R Markdown veya Jupyter Notebook formatında paylaşılan çalıştırılabilir raporlar.
Yayın standartlarına uygun vektör formatında (PDF, SVG) grafikler, ısı haritaları, ağ diyagramları ve istatistiksel özet tabloları.
İstatistiksel bulguların özetlendiği, önemli genlerin veya proteinlerin listelendiği ve sonraki adımlar için öneriler içeren kapsamlı sonuç dokümanları.
Solvien ekosisteminden güncellemeler, araştırma notları ve ürün gelişmeleri. Yazılım, biyoteknoloji ve robotik alanlarındaki çalışmalarımızdan düzenli ve seçilmiş içerikler.
